Đối với hàng hóa xuất khẩu theo diện quản lý giấy phép hạn ngạch, Thương nhân phải nộp đơn xin cấp giấy phép tới cơ quan chủ quản thương vụ, trong vòng 30 ngày kể từ khi nhận đơn, cơ quan quản lý thương vụ phải trả lời được cấp giấy phép hay không. Thương nhân kinh doanh xuất khẩu căn cứ vào giấy chứng nhận do cơ quan quản lý giấy phép xuất khẩu làm thủ tục khai báo hải quan tại Hải quan.